Зубр относится к роду бизонов (Bison), который появился в конце третичного периода в плиоцене в Юго-Восточной Азии. В плейстоцене его представители заселили территорию современных Европы и Азии, перейдя по Берингову перешейку в Северную Америку. Самые старые обнаруженные ископаемые остатки зубра датируются началом плейстоцена и насчитывают от одного до двух миллионов лет. Помимо европейского зубра, в настоящее время, к роду бизонов относится ещё лишь один вид — американский бизон (Bison bison). Степные зубры (Bison priscus) вымерли в конце плейстоцена, когда были замещены в Европе современными зубрами, а в Северной Америке — американским бизоном.